14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2070 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  249  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0817  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595251  hitchhiker  0.0010958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2651  hypothetical protein  50.4 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3218  hypothetical protein  46.34 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.648594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3226  hypothetical protein  44.17 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0841  hypothetical protein  43.8 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03910  hypothetical protein  42.98 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2838  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1307  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.478307  normal  0.112678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2067  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169668  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1242  hypothetical protein  37.01 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451086  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2598  hypothetical protein  37.01 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0236117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2912  hypothetical protein  37.01 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.887727  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2763  hypothetical protein  36.22 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>