20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1538 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3155  hypothetical protein  97.73 
 
 		 57 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  90.74 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  62.12 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  61.54 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  54.67 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  62.96 
 
 		 55 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  60.38 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  58.49 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  57.41 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  57.41 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  56.6 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  51.79 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  46.3 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  46.94 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  37.7 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  46.94 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  46.81 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  41.07 
 
 		 52 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  42.31 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>