57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1399 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  56.19 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  55.9 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  55.9 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  42.25 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  39.91 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  40.1 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  37.69 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  33.18 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  44.27 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  47.27 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  39.72 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  39.72 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  24.4 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  32.21 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  39.81 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  25.82 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  28.65 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  37.38 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  28.5 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  40.66 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  26.97 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  27.75 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  29.61 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  24.6 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  29.02 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  23.75 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  43.84 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.57 
 
 		 397 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  25.9 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  26.45 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  42.65 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  31.58 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  31.58 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  30.2 
 
 		 146 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  26.43 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  40 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  44.23 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  33.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  36.92 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  36.92 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  36.92 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  28.05 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  26.85 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  39.68 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  30.85 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  35.16 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  40.62 
 
 		 191 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  24.36 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>