18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1320 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1577  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401749  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1320  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0990906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0583  hypothetical protein  65.69 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2236  hypothetical protein  65.69 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  64.96 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3618  hypothetical protein  62.69 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.852641  normal  0.135457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  62.04 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  58.52 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  39.71 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  38.97 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  38.97 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  44.09 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0016  hypothetical protein  42.24 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0137  hypothetical protein  37.88 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171445  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0216  hypothetical protein  41.22 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378879  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0187  hypothetical protein  40.46 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0579  hypothetical protein  39.1 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>