20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0830 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  100 
 
 
156 aa  308  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  50.97 
 
 
156 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  47.1 
 
 
156 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  45.75 
 
 
155 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  43.87 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  43.95 
 
 
158 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  41.94 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  45.62 
 
 
160 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  45.33 
 
 
154 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  39.35 
 
 
156 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  45.51 
 
 
156 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  38.71 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  44.87 
 
 
156 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  41.94 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  41.29 
 
 
156 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  39.74 
 
 
149 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
149 aa  92  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  38.52 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  37.88 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  36.97 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>