17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1123 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1123  GTP cyclohydrolase IIA  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1351  GTP cyclohydrolase IIA  58.82 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0394455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0384  GTP cyclohydrolase IIA  56.56 
 
 		 221 aa  279  3e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1743  GTP cyclohydrolase IIA  59.28 
 
 		 221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0670897 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1377  GTP cyclohydrolase IIa  26.36 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0982803  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0049  GTP cyclohydrolase IIA  28.95 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0787957  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3329  GTP cyclohydrolase IIa  23.27 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.828115  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0818  GTP cyclohydrolase III  23.43 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.755555  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1393  GTP cyclohydrolase III  24.19 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1614  GTP cyclohydrolase IIA  22.22 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1998  GTP cyclohydrolase III  26.25 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2633  GTP cyclohydrolase IIa  26.72 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.808385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0505  GTP cyclohydrolase III  23.53 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2188  GTP cyclohydrolase III  25.1 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0683488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1403  GTP cyclohydrolase III  23.11 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1233  GTP cyclohydrolase III  23.11 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0458897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1598  GTP cyclohydrolase IIa  22.45 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>