20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0306 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 128 aa  251  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  75.96 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  71.3 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  70.41 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  36.57 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  43.33 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  37.35 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  37.08 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  37.08 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  35.96 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  33.33 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  33 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  34.83 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  35.23 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  34.38 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  31.46 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  32.38 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  31.07 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>