23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4216 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4216  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0469  hypothetical protein  36.41 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3379  hypothetical protein  37.77 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3798  hypothetical protein  39.53 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.750797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0399  hypothetical protein  35.11 
 
 		 174 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4205  hypothetical protein  32.98 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4102  hypothetical protein  36.16 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0500  hypothetical protein  32.02 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00563  hypothetical protein  31.5 
 
 		 178 aa  94.7  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3557  hypothetical protein  32.98 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0521  hypothetical protein  36.13 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.704263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0455  hypothetical protein  35.47 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3208  hypothetical protein  35.98 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0413  hypothetical protein  29.74 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0425  hypothetical protein  29.74 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0439  hypothetical protein  30.73 
 
 		 175 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.177826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3901  hypothetical protein  28.72 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3731  hypothetical protein  31.91 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.930298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0166  hypothetical protein  32.28 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0864  hypothetical protein  26.23 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.847046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0170  hypothetical protein  23.73 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0707  hypothetical protein  25.56 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0863  hypothetical protein  35.59 
 
 		 254 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>