23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3952 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3952  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3711  hypothetical protein  68.49 
 
 		 80 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3709  hypothetical protein  63.51 
 
 		 73 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0310  hypothetical protein  63.51 
 
 		 73 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0315  hypothetical protein  62.16 
 
 		 73 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.90376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4402  hypothetical protein  62.16 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03528  hypothetical protein  60.53 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000347587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0608  hypothetical protein  58.11 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.51686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0313  hypothetical protein  58.11 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.487449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0319  hypothetical protein  58.11 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0318  hypothetical protein  58.11 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0314  hypothetical protein  58.11 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0417  hypothetical protein  59.46 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3546  hypothetical protein  59.46 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.208277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0330  hypothetical protein  54.05 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3405  hypothetical protein  56.76 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3449  hypothetical protein  56.76 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3910  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0301  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.343727  hitchhiker  0.0000000789061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2598  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.103252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4619  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4248  hypothetical protein  48.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3431  hypothetical protein  56.76 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>