17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3492 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 236 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  69.8 
 
 		 205 aa  321  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  70.53 
 
 		 235 aa  318  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  69.57 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  28.64 
 
 		 827 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  28.24 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  30.05 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  25.38 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  29.74 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  27.14 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  24.79 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  25.68 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  26.19 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  22.17 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  27.78 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>