18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1956 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1956  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.784413  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0913  putative lipoprotein  62.2 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.403622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0840  putative lipoprotein  61.42 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0819  hypothetical protein  60.77 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0901  hypothetical protein  59.38 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.746833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  68.27 
 
 		 274 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3432  hypothetical protein  64.76 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1881  hypothetical protein  54.62 
 
 		 133 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.779874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2534  hypothetical protein  59.81 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1600  hypothetical protein  62.5 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.039384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3390  hypothetical protein  62.75 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.420538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2466  hypothetical protein  59.62 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0868  hypothetical protein  49.66 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0592  hypothetical protein  59.62 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.66 
 
 		 276 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1125  hypothetical protein  58.65 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2027  hypothetical protein  56.07 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2898  hypothetical protein  31.3 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191774  normal  0.0195935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>