66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1778 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  75.45 
 
 		 174 aa  275  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  57.99 
 
 		 169 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  57.99 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  57.4 
 
 		 169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  58.58 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  210  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  197  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  197  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  55.09 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  195  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  54.82 
 
 		 168 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  51.2 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  44.25 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  46.78 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  165  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  46.34 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  45.73 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  42.53 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  45.22 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  42.2 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  44.38 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  45.98 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  42.6 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  40.72 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  42.29 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  44.51 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  44.1 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  46 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  47.66 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  34.16 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  35.09 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  33.17 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  43.55 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  42.34 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  35.43 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  30.12 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  27.94 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  38.64 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  26.22 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  34.53 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  28.95 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  25.43 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  29.82 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  23.72 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  28.45 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  33.65 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  27.52 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  24.39 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  26.32 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>