73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1565 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  46.63 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  45.89 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  45.27 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  43.24 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  41.67 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  41.38 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  41.38 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  41.38 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  41.38 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  41.22 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  42.07 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  39.87 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  43.45 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  41.51 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  39.24 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  39.24 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  40 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  33.73 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  34.84 
 
 		 210 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.68 
 
 		 184 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.68 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.51 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.61 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  32.05 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  29.68 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.47 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.47 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.47 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.17 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.38 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.38 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.38 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.81 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  28.67 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  27.21 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  28.29 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  24.85 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  27.33 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  29.17 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  26.58 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  27.7 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  27.63 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  30.83 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  24.31 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  25.66 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  24.53 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  27.11 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  22.36 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  28.57 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  25.66 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  25 
 
 		 201 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  22.98 
 
 		 220 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  25.17 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  29.45 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>