23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1279 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1279  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 840 aa  1749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02992  type IV pilus assembly PilZ  44.48 
 
 		 841 aa  755    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.488872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1106  hypothetical protein  28.87 
 
 		 822 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3541  type IV pilus assembly PilZ  29.4 
 
 		 805 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0300151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0980  hypothetical protein  29.1 
 
 		 792 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.218662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1009  type IV pilus assembly PilZ  28.55 
 
 		 794 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3371  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 804 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2808  type IV pilus assembly PilZ  27.62 
 
 		 796 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000659651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3033  type IV pilus assembly PilZ  28.62 
 
 		 805 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3359  type IV pilus assembly PilZ  28.08 
 
 		 793 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3221  type IV pilus assembly PilZ  28.2 
 
 		 793 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1048  type IV pilus assembly PilZ  28.01 
 
 		 790 aa  319  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.023963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1044  type IV pilus assembly PilZ  28.13 
 
 		 790 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.713733  hitchhiker  0.00851048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1147  type IV pilus assembly PilZ  27.99 
 
 		 793 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1034  type IV pilus assembly PilZ  26.88 
 
 		 796 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1225  hypothetical protein  27.65 
 
 		 792 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1109  type IV pilus assembly PilZ  27.53 
 
 		 790 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.618893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2815  type IV pilus assembly PilZ  27.64 
 
 		 795 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3220  type IV pilus assembly PilZ  27.62 
 
 		 804 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1923  hypothetical protein  27.37 
 
 		 779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.453342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0625  hypothetical protein  25.42 
 
 		 781 aa  264  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.432521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002635  hypothetical protein  26.03 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.729255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03371  hypothetical protein  24.66 
 
 		 782 aa  247  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>