22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1049 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  70.45 
 
 		 576 aa  804    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  68.23 
 
 		 564 aa  778    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1159    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  54.77 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  59.49 
 
 		 555 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  37.72 
 
 		 555 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  37.09 
 
 		 599 aa  349  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  38.06 
 
 		 565 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  38.55 
 
 		 565 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  39.22 
 
 		 565 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  38.39 
 
 		 560 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  35.91 
 
 		 565 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  36.91 
 
 		 545 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  32.92 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2965  hypothetical protein  24.42 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.711778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  24.49 
 
 		 671 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  26.87 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3161  hypothetical protein  23.73 
 
 		 664 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  22.74 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3053  hypothetical protein  23.73 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88224  dipeptidyl-peptidase III (DPP III) (Dipeptidyl aminopeptidase III) (Dipeptidyl arylamidase III)  26.55 
 
 		 693 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.01841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2908  hypothetical protein  20.91 
 
 		 663 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0753895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>