19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0715 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0715  putative bacteriophage protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.851836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0931  putative bacteriophage protein  45.88 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2784  phage protein  45.62 
 
 		 195 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2919  phage protein  45.62 
 
 		 195 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0894575  hitchhiker  0.000000000302279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3475  phage protein  45 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0686  hypothetical protein  40.48 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5070  hypothetical protein  40.48 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1044  hypothetical protein, putative phage gene  44.97 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0913  phage-like protein  45.89 
 
 		 211 aa  141  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4007  hypothetical protein  42.5 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1038  hypothetical protein  43.04 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1452  hypothetical protein  37.42 
 
 		 203 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2749  hypothetical protein  37.42 
 
 		 203 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.815887  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0256  hypothetical protein  37.8 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05043  hypothetical protein  36.18 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0571  hypothetical protein  39.58 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809669  normal  0.240365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1301  hypothetical protein  36.49 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0739  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3392  hypothetical protein  39.34 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>