25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0542 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  41.4 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  46 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  39.49 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  41.1 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  41.1 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  45.71 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  42.48 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  42.48 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  43.36 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  35.67 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  45.32 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  37.21 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2685  hypothetical protein  34.44 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  hitchhiker  0.000194293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  26.47 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  27.03 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  25.9 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  25.9 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  27.74 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  25.53 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1161  hypothetical protein  27.07 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0275  hypothetical protein  26.47 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000890841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  17.86 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>