49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0142 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  61.07 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  51.03 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  48.43 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  46.54 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  49.02 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  41.42 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  39.29 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  42.48 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  56.6 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  56.6 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 212 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  40.91 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  43.14 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  40.79 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  39.87 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  39.31 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  40.94 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  40.67 
 
 		 213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  37.97 
 
 		 214 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  34.52 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  38.84 
 
 		 193 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  37.67 
 
 		 183 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  38.26 
 
 		 184 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  40.87 
 
 		 232 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  36.09 
 
 		 178 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  34.29 
 
 		 195 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  33.95 
 
 		 203 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  34.13 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  45.92 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  36.77 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  35.14 
 
 		 197 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  33.54 
 
 		 180 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  40.37 
 
 		 204 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  34.87 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  35.57 
 
 		 189 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  35.57 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  33.55 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  37.69 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  33.12 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  37.17 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  43.37 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  38.38 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  29.88 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1198  hypothetical protein  35.19 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249406  normal  0.127794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>