21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1438 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  76.19 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  70.19 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  71.57 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  39.83 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  40.18 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  38.55 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  39.02 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  35.8 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  39.51 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  39.51 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  35.96 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  32.18 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  30.95 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  29.63 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  29.9 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  29.89 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  28.57 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.19 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  26.13 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  29.35 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>