13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1311 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1311  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  357  7e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  83.82 
 
 		 184 aa  309  1e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  82.29 
 
 		 175 aa  308  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1784  THUMP domain-containing protein  84.97 
 
 		 174 aa  306  6.999999999999999e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1953  THUMP domain-containing protein  46.75 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0214  THUMP domain-containing protein  34.91 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1428  THUMP domain-containing protein  31.55 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  35.51 
 
 		 360 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43859  predicted protein  31.4 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00122595  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  33.67 
 
 		 364 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1655  THUMP domain-containing protein  27.22 
 
 		 359 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.57853  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18762  predicted protein  26.85 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  30.53 
 
 		 362 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>