28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03908 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  658    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  59.68 
 
 
319 aa  345  8.999999999999999e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  59.68 
 
 
319 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  57.56 
 
 
321 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  35.56 
 
 
328 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  35.96 
 
 
335 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  32.61 
 
 
334 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  33.23 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  32.41 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  36.23 
 
 
369 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  36.23 
 
 
374 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  36.74 
 
 
361 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  35.47 
 
 
349 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  39.25 
 
 
324 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  33.56 
 
 
339 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  33.46 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  34.63 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  35.62 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  35.59 
 
 
779 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.71 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.54 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.73 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  24.55 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  29.13 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.3 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  24.46 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  33.91 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  28.82 
 
 
316 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>