14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03409 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03409  HrpD5  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0857  HRPW transmembrane protein  31.23 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0240135 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0672  secretion-associated protein  32.13 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2274  putative type III secretion apparatus protein  32.13 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2192  putative type III secretion apparatus protein  32.13 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5864  sctD; secretion-associated protein  30.82 
 
 		 346 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0473  secretion-associated protein  31.35 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0758  serine protease  31.97 
 
 		 335 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1912  putative secretion-associated protein  30.4 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5647  SctD; secretion-associated protein  29.07 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0177431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0432  secretion-associated protein  30 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2004  secretion-associated protein  29.6 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5925  putative type III secretion apparatus protein  31.92 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1961  transmembrane protein  33.33 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>