13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5527 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5527  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5076  hypothetical protein  80.3 
 
 		 127 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5270  hypothetical protein  60.33 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5656  hypothetical protein  66.67 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5362  hypothetical protein  57.5 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303091  normal  0.949027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5411  hypothetical protein  57.85 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5140  hypothetical protein  62 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6340  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73030  hypothetical protein  57.28 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29230  hypothetical protein  42.71 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3249  putative signal peptide protein  39.08 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3438  putative signal peptide protein  41.1 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4070  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0450708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>