14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5348 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5348  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3242  hypothetical protein  34.2 
 
 		 489 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1418  hypothetical protein  31.32 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20510  hypothetical protein  33.2 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6291  hypothetical protein  28.27 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3160  hypothetical protein  48.44 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1789  hypothetical protein  45 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6294  hypothetical protein  42.03 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1057  hypothetical protein  32.05 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1186  hypothetical protein  40.98 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0235  hypothetical protein  45.76 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5084  hypothetical protein  37.31 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000765562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2360  hypothetical protein  36.07 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3225  hypothetical protein  32.31 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>