11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4873 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4873  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4413  hypothetical protein  77.32 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4703  hypothetical protein  30.59 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6119  hypothetical protein  26.98 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4881  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6384  hypothetical protein  24.59 
 
 		 942 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6120  hypothetical protein  27.06 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0569  hypothetical protein  25.73 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4901  hypothetical protein  23.66 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.367237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0327  hypothetical protein  22.73 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0306  hypothetical protein  22.48 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>