17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4036 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  92.36 
 
 		 171 aa  257  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  82.09 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  58.86 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4095  hypothetical protein  45.81 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1357  hypothetical protein  46.81 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  0.260682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1584  hypothetical protein  46.15 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.350086  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3359  hypothetical protein  40.4 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  43.52 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  47.06 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  39.07 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  31.41 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  29.19 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  31.82 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  32.03 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  32.68 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1643  hypothetical protein  33.12 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>