18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4007 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0686  hypothetical protein  75.86 
 
 		 174 aa  276  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5070  hypothetical protein  75.86 
 
 		 174 aa  276  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0913  phage-like protein  44.25 
 
 		 211 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1044  hypothetical protein, putative phage gene  45.51 
 
 		 196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0931  putative bacteriophage protein  46.95 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2784  phage protein  48.73 
 
 		 195 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2919  phage protein  48.73 
 
 		 195 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0894575  hitchhiker  0.000000000302279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3475  phage protein  48.73 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1452  hypothetical protein  42.01 
 
 		 203 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2749  hypothetical protein  42.01 
 
 		 203 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.815887  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0571  hypothetical protein  48 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809669  normal  0.240365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0715  putative bacteriophage protein  42.5 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.851836  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1038  hypothetical protein  49.63 
 
 		 219 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0256  hypothetical protein  40.96 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05043  hypothetical protein  37.33 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0739  hypothetical protein  40.12 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1301  hypothetical protein  39.29 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>