15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3932 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  347  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  60.37 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  58.86 
 
 		 159 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  70.4 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4095  hypothetical protein  39.87 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1357  hypothetical protein  45.37 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  0.260682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3359  hypothetical protein  38.16 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1584  hypothetical protein  35.67 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.350086  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  39.45 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  30.64 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  34.56 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2419  hypothetical protein  38.26 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  29.7 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  41.28 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  28.31 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>