24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3908 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  94.8 
 
 		 174 aa  327  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  58.99 
 
 		 180 aa  223  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  55.17 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  54.02 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  53.45 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  56.29 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  55.75 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  51.45 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  50.29 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  46 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  37.88 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2685  hypothetical protein  33.1 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  hitchhiker  0.000194293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  23.29 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  23.19 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  23.91 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  24.24 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  22.6 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  22.6 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  22.6 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  23.19 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1161  hypothetical protein  22.3 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  20 
 
 		 173 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>