13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3626 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  92.59 
 
 		 135 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  59.15 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  56.94 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  56.94 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  55.17 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  60.9 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  41.98 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  43.55 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  38.78 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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