60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3395 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3395  major tail tube protein  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4039  phage major tail tube protein  85.8 
 
 		 169 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1213  phage major tail tube protein  76.33 
 
 		 169 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3060  pyocin R2_PP, tail tube protein  73.96 
 
 		 169 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0766  phage major tail tube protein  68.86 
 
 		 167 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08090  putative phage tail tube protein  68.86 
 
 		 167 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.01522e-16  hitchhiker  0.000177161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1859  phage major tail tube protein  55.69 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0574  contractile tail tube protein  47.9 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0396  hypothetical protein  45.56 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1135  hypothetical protein  45.56 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1157  phage major tail tube protein  45.56 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0748  Phage major tail tube protein  43.71 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1283  phage major tail tube protein  40.96 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2591  phage major tail tube protein  42.6 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213211  hitchhiker  0.0000000491617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2625  phage major tail tube protein  42.6 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169014  hitchhiker  0.000000417422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3309  phage major tail tube protein  42.51 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01343  phage major tail tube protein  40.96 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4857  phage major tail tube protein  39.52 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.662174  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0862  phage major tail tube protein  41.42 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37390  Phage P2 FII-like protein  39.05 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1917  phage major tail tube-like protein  41.76 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2492  phage major tail tube protein FII  39.64 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0943  phage major tail tube protein  39.64 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2755  phage major tail tube protein  39.05 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395908 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2847  phage major tail tube protein FII  39.64 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0184  phage major tail tube protein  40.12 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3030  phage major tail tube protein FII  39.64 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2188  tail tube protein  40.12 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2348  phage major tail tube protein  40.12 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2301  phage major tail tube protein  40.12 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0886  phage major tail tube protein  40.12 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3193  phage major tail tube protein  38.15 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3325  phage major tail tube protein  38.75 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2377  phage major tail tube protein  38.75 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1629  contractile tail tube protein  37.13 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6178  putative phage tail tube protein FII  38.32 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2294  phage major tail tube protein  39.38 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3481  phage major tail tube protein  37.06 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2100  phage major tail tube protein  35.29 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4384  phage major tail tube protein  37.06 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  hitchhiker  0.00216256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1814  phage major tail tube protein  35.88 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00232841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1378  phage major tail tube protein  38.1 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4346  phage major tail tube protein FII  35.26 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3029  phage major tail tube protein FII  35.26 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2674  phage major tail tube protein  40.59 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0110743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2663  phage major tail tube protein  34.32 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2894  phage major tail tube protein  34.32 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1330  phage major tail tube protein  33.53 
 
 		 169 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2918  prophage MuMc02, major tail tube protein  33.93 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2212  hypothetical protein  32.45 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1566  phage major tail tube protein  25 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2896  phage major tail tube protein  25 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0578  major tail tube protein  31.08 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4129  major tail tube protein  28.19 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4468  phage major tail tube protein  27.27 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4553  phage major tail tube protein  27.27 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00640021  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4552  phage major tail tube protein  25 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  0.36933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0924  major tail tube protein  27.54 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4913  major tail tube protein  26.7 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.79604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1490  Phage tail tube protein FII-like protein  29.08 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>