34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2824 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  100 
 
 		 487 aa  989    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  57.26 
 
 		 532 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  52.67 
 
 		 526 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  39.08 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  35.58 
 
 		 547 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  26.06 
 
 		 559 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.76 
 
 		 586 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  29.22 
 
 		 417 aa  94  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  22.95 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.77 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  24.65 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  23.33 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  22.03 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  22.01 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  22.42 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  23.39 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  21.17 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  22.05 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  20.69 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  23.44 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  33.33 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  34.62 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  34.12 
 
 		 128 aa  57  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  21.79 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  23.27 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  32.05 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  33.33 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  25.56 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  25.52 
 
 		 514 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  25.52 
 
 		 514 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  19.95 
 
 		 502 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  31.34 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  31.33 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  23.43 
 
 		 562 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>