12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2684 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2684  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  219  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2417  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  219  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230843  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3714  hypothetical protein  51.97 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4471  hypothetical protein  47.56 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0901  hypothetical protein  39.82 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2298  hypothetical protein  42.53 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2394  hypothetical protein  43.02 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.957561  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2434  hypothetical protein  43.02 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3981  hypothetical protein  45.12 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5715  hypothetical protein  41.38 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1777  hypothetical protein  41.38 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2389  hypothetical protein  39.81 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>