20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2143 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2143  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1953  hypothetical protein  95.45 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0717827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3925  hypothetical protein  76.15 
 
 		 110 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2092  hypothetical protein  78.65 
 
 		 106 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3799  hypothetical protein  71.15 
 
 		 106 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.830774  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2117  hypothetical protein  76.67 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178867  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1970  hypothetical protein  77.53 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2854  hypothetical protein  79.76 
 
 		 109 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33580  hypothetical protein  79.76 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312917  normal  0.0307116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2392  hypothetical protein  73.81 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0467804  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3597  hypothetical protein  64.08 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.879973  normal  0.208476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2043  hypothetical protein  56.98 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0647  hypothetical protein  45.24 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.173269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1552  hypothetical protein  37.63 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0311894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1562  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00388026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2054  hypothetical protein  33.64 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06747  hypothetical protein  29.81 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0121  hypothetical protein  30.86 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>