21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2094 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  95.36 
 
 		 159 aa  256  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  77.85 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  60.37 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4095  hypothetical protein  45.96 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1584  hypothetical protein  46.41 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.350086  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1357  hypothetical protein  45.83 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  0.260682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3359  hypothetical protein  37.2 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  43.93 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  47.22 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  38.32 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  32.54 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  27.12 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  31.25 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  31.45 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  27.84 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2419  hypothetical protein  42.24 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2082  hypothetical protein  32.35 
 
 		 177 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1435  hypothetical protein  32.35 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1643  hypothetical protein  33.12 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2706  bacteriophage lysis protein  32.82 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>