30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0866 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  84.21 
 
 		 130 aa  199  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  56.36 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  58 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36230  hypothetical protein  55.45 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  50.93 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  49.07 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  48.15 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  49.07 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  49.07 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  47.27 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  45.37 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  52.08 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  49.04 
 
 		 136 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  50.5 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  47.17 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  49.11 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  52.63 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  51.58 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  51.92 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  34.69 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  32.67 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  30.69 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2760  hypothetical protein  26.36 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>