10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0147 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28200  hypothetical protein  58.7 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6521  hypothetical protein  43.36 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1631  hypothetical protein  44.95 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000804863  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1188  hypothetical protein  43.21 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4293  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4073  hypothetical protein  32.58 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1967  hypothetical protein  32.58 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.878388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  27.86 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>