18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5738 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5738  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66150  hypothetical protein  93.62 
 
 
298 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0475  Mig-14  76.17 
 
 
298 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.496349  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4942  Mig-14 family protein  72.73 
 
 
298 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4814  Mig-14 family protein  72.73 
 
 
298 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4991  Mig-14 family protein  72.39 
 
 
298 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0526  Mig-14 family protein  71.04 
 
 
298 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254564  normal  0.164159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0530  Mig-14  68.46 
 
 
298 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4990  hypothetical protein  68.46 
 
 
298 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0595  Mig-14 family protein  67.79 
 
 
298 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44700  Mig-14 family protein  60.4 
 
 
298 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0097  Mig-14 family protein  26.19 
 
 
302 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028214  hitchhiker  0.0000000164486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2893  Mig-14  26.13 
 
 
298 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3080  Mig-14  26.13 
 
 
298 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2958  hypothetical protein  26.13 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  hitchhiker  0.0000324409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2924  Mig-14  26.13 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2977  hypothetical protein  25.78 
 
 
298 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1493  Mig-14 family protein  28.07 
 
 
296 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal 
 
 
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