14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4243 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4243  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49810  hypothetical protein  87.69 
 
 
195 aa  324  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3019  hypothetical protein  30.43 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4278  hypothetical protein  31.89 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3589  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.348708  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0647  hypothetical protein  27.89 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0620  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4820  hypothetical protein  28.66 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793839  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0534  hypothetical protein  26.49 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1175  hypothetical protein  26.74 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0216  hypothetical protein  26.09 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.636809  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1361  hypothetical protein  32.94 
 
 
540 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  35.71 
 
 
1028 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  36.36 
 
 
1042 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>