13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3843 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  100 
 
 		 137 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  92.75 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  50.78 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  45.83 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  45.14 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  46.48 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  45.71 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  42.45 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  52.5 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  42.45 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  45.19 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>