58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3352 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  98.68 
 
 		 379 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  72.21 
 
 		 401 aa  544  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  64.99 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  34.52 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  32.56 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  30.88 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  31.86 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  31.36 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  31.2 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  30.47 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  29.66 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  30.31 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  32.1 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  28.76 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  31.82 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  30.95 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  31.38 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  30.32 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  32.15 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  27.81 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  34.43 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  30.09 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  32.28 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  31.3 
 
 		 362 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  30.92 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  29.62 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  30.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  30.92 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  28.45 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  28.78 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  29.89 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  29.73 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  30.11 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  29.66 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  28.53 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  26.33 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40324  Peroxisomal catalase (PXP-9)  24.39 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  24.32 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  25.68 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05918  Catalase (EC 1.11.1.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HDP7]  24.77 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  25.45 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  24.39 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  28.66 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  28.66 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  28.66 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  31.2 
 
 		 709 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  27.43 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  32.65 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  27.43 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  23.42 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  26.49 
 
 		 498 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  25.27 
 
 		 335 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  31.4 
 
 		 504 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  26.95 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  32.65 
 
 		 496 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  30 
 
 		 485 aa  42.7  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  28.05 
 
 		 479 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>