11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2335 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2335  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27590  hypothetical protein  98.83 
 
 
257 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1915  hypothetical protein  64.98 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0846835  normal  0.46148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1487  hypothetical protein  62.65 
 
 
255 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1878  hypothetical protein  61.09 
 
 
255 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3837  hypothetical protein  60.7 
 
 
280 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1453  hypothetical protein  60.31 
 
 
255 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.150556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1785  hypothetical protein  58.75 
 
 
256 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3609  hypothetical protein  57.71 
 
 
252 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0064832  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4191  hypothetical protein  61.26 
 
 
252 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1168  hypothetical protein  19.7 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000323941  hitchhiker  0.00000154553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>