17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1477 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1477  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16980  hypothetical protein  94.02 
 
 
117 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.993879  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0243  hypothetical protein  79.49 
 
 
117 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2081  hypothetical protein  69.09 
 
 
117 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2168  hypothetical protein  67.27 
 
 
117 aa  168  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1338  hypothetical protein  72.73 
 
 
117 aa  167  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4062  hypothetical protein  68.18 
 
 
117 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0198  hypothetical protein  65.81 
 
 
117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1487  hypothetical protein  67.27 
 
 
117 aa  161  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00715013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0233  hypothetical protein  65.81 
 
 
117 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0099  hypothetical protein  64.1 
 
 
135 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5272  hypothetical protein  64.96 
 
 
117 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5324  hypothetical protein  64.96 
 
 
117 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0635702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5182  hypothetical protein  64.96 
 
 
117 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535352  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1508  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5528  hypothetical protein  64.1 
 
 
117 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3013  hypothetical protein  59.83 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>