74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1120 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  97.1 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  57.28 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  55.34 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  56.04 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  52.43 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  52.91 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  52.43 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  53.4 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  52.43 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  53.62 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.92 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  25.64 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  27.27 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  27.27 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  25.53 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  27.89 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.82 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  30.28 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.24 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  30.67 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.15 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  30.67 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  27.33 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.06 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.06 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.06 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  29.25 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  30.71 
 
 		 167 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  30.06 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  28.67 
 
 		 163 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  27.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  28.28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  29.01 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  28.93 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  23.84 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  32.41 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  28.66 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  26.58 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  28.66 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  28.78 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  25.44 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  27.92 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0565  hypothetical protein  25.82 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  32.61 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.68 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0575  hypothetical protein  27.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000903438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  28.77 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  28.77 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  26.01 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  26 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  27.27 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  23.94 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  27.1 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 164 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  25.35 
 
 		 187 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2345  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  24.67 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  24.67 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  24.67 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>