13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5009 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  100 
 
 		 1586 aa  3231    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  95.65 
 
 		 1586 aa  3073    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  40.95 
 
 		 1565 aa  1127    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1555 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1571 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1559 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1530 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1527 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1742 aa  72  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  30.49 
 
 		 859 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1743 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4544  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1844 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1830 aa  47.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>