12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4906 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4906  metal-dependent hydrolase HDOD  100 
 
 		 511 aa  1023    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4782  metal-dependent hydrolase HDOD  99.41 
 
 		 511 aa  1019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4959  metal-dependent hydrolase HDOD  97.26 
 
 		 511 aa  931    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4698  metal-dependent hydrolase HDOD  83.76 
 
 		 511 aa  827    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0511  signal transduction protein  61.76 
 
 		 512 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4954  hypothetical protein  62.67 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0560  hypothetical protein  62.67 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0623  HDOD  52.76 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5684  HDOD domain-contain protein  53.32 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65470  hypothetical protein  52.92 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  21.86 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  21.84 
 
 		 463 aa  43.9  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
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