28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4272 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4272  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1596  hypothetical protein  96.91 
 
 		 162 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3836  hypothetical protein  91.98 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3588  hypothetical protein  73.08 
 
 		 161 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2903  hypothetical protein  58.39 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2683  hypothetical protein  58.39 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3390  hypothetical protein  50.31 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4237  hypothetical protein  49.69 
 
 		 165 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4129  hypothetical protein  49.69 
 
 		 165 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402697  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0422  hypothetical protein  53.79 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01185  hypothetical protein  51.66 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1716  hypothetical protein  54.01 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4463  hypothetical protein  48.05 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0446649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1906  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74595  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1862  hypothetical protein  47.95 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588861  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0037  hypothetical protein  51.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2696  hypothetical protein  51.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1856  hypothetical protein  51.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3271  hypothetical protein  51.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0250  hypothetical protein  51.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0037  hypothetical protein  51.03 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3348  hypothetical protein  47.92 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1681  hypothetical protein  44.22 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000247  permease  41.61 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3769  hypothetical protein  40.94 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00090  predicted membrane protein  38.26 
 
 		 159 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1783  hypothetical protein  35.86 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3786  hypothetical protein  32.86 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0426513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>