19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3861 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  100 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  47.54 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  48.36 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  48.36 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  49.61 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  54.92 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  41.18 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  40 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  42.62 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  45.92 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  45.92 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  41.8 
 
 		 405 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  47.75 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  45.92 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  40.98 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  37.3 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  37.9 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  37.9 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  34.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>