12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3482 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3482  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2289  hypothetical protein  96.53 
 
 		 259 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499712  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2455  hypothetical protein  94.59 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2464  hypothetical protein  85.61 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1983  hypothetical protein  49.42 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.299158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29140  hypothetical protein  45.78 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.463787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1296  hypothetical protein  28.7 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0320788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2587  hypothetical protein  29.71 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1340  hypothetical protein  27.18 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  35.4 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2418  hypothetical protein  34.97 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3224  hypothetical protein  30.23 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>