12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2809 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2809  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2740  hypothetical protein  47.42 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.286647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5046  hypothetical protein  48.15 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776863  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5814  hypothetical protein  48.15 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4365  hypothetical protein  48.34 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4454  hypothetical protein  44.1 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327935  normal  0.0437667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6792  hypothetical protein  42.79 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6835  hypothetical protein  40.99 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446166  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6397  hypothetical protein  40.8 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933792  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6827  hypothetical protein  44.04 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0370617  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2896  hypothetical protein  36.82 
 
 		 229 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6574  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>